| Российский химико-аналитический
портал |
химический анализ и аналитическая химия в фокусе внимания ::: портал химиков-аналитиков ::: выбор профессионалов |
 |
|
| ANCHEM.RU » Форумы » 1. Аналитический форум ... |
 |
построение 3D поверхностей по данным ГХ-МС >>>
|
 |
|
OldBrave VIP Member Ранг: 1330 |
 20.01.2019 // 2:25:41
Редактировано 1 раз(а) Тут даже не диапазон масс существенен, а необходимо устанавливать срезы по оси времени в соответствии с max общего ионного тока. Естественно, ни о какой "поверхности" речи не должно идти. Полезной информативности от такой карты - ноль, - много работы и нулевой реальный выхлоп, можно, правда, показать картинку дилетантам... |
||
|
ANCHEM.RU Администрация Ранг: 246 |
|||
|
trix Пользователь Ранг: 4 |
21.01.2019 // 12:41:10
Спасибо за помощь, ссылка на архив В данных ничего секретного, ГХ-МС анализ проведен мною. Эти данные полностью сырые, без вычитания фона. Вполне понимаю критику, но пока сам не попробуешь, не поймешь, насколько результаты будут применимы. В любом случае, если в науке каждую идею, тем более не невыполнимую, отбрасывать без проверки, то результата не будет точно... Благодарю всех отписавшихся, если у кого-то будут еще какие-то идеи, рад буду услышать. |
||
|
vmu Пользователь Ранг: 1330 |
22.01.2019 // 0:16:57
У меня в SigmaPlot 11.0 получились такие картинки: https://yadi.sk/d/Xfmd54LOAbvA9A 3D график можно назвать более-менее наглядным, но с натяжкой. Контурные карты, как и предполагалось, можно использовать (но тоже с натяжкой) только для узких интервалов времен и m/z. Программа при обработке данных прилично тормозит, особенно с 3D графиком. Несколько ускоряет процесс использование только каждой десятой точки по оси времени. Ширины пиков на хроматограмме более-менее позволяют уменьшить дискретизацию по оси времени в 10 раз (для пиков в начале хроматограммы форма пика все же заметно искажается). По оси m/z дискретизация как есть в исходном файле (т.е. целочисленные m/z). |
||
|
gennadyrs Пользователь Ранг: 11 |
23.01.2019 // 14:29:13
А этой программой можно открыть .csv. По крайней мере файл, который здесь упоминается. gesen.narod.ru/bcs.zip Спектрохроматограмма слишком большая, поэтому открывается долго и плохо видно пики без увеличения. Кроме того данные отображаются как они есть и нет плавных переходов между уровнями. |
||
|
vmu Пользователь Ранг: 1330 |
23.01.2019 // 15:20:21
Файлы .csv открываются в Excel. Только для присланного большого файла нужна свежая версия. Версия 2003 и более ранние имеют ограничение в 65536 строк. Все там нормально отображается. Возьмите, например, m/z 57 и посторойте график зависимости сигнала от времени. Получится нормальная хроматограмма. А между разными m/z и не должно быть плавных переходов. |
||
|
Каталог ANCHEM.RU Администрация Ранг: 246 |
|
||
|
gennadyrs Пользователь Ранг: 11 |
23.01.2019 // 16:34:35
Редактировано 1 раз(а) Если это ответ на моё сообщение, то я знаю, что в эксель можно эти файлы открывать. И даже можно строить графики. Можно даже ухитриться посчитать площадь. Только большинство хроматографистов предпочитают хроматографическое програмное обеспечение для работы с хроматограммами. А любителям эксель никто не запрещает мучиться с эксель. |
||
|
vmu Пользователь Ранг: 1330 |
23.01.2019 // 17:07:31
Редактировано 1 раз(а) Да, теперь глянул ваш архив. Занятная программка. Хроматографисты, конечно, предпочитают хроматографическое програмное обеспечение (особенно фирменное, поставленное вместе с хроматографом), но в Excel можно тоже делать полезные вещи, которые нельзя сделать, используя то или иное фирменное хроматографическое ПО. Никаких мучений. |
||
|
gennadyrs Пользователь Ранг: 11 |
12.02.2019 // 16:40:03
У меня нет ни одного устройства с Виндовс. Как мне воспользоваться фирменными программами, если я не хочу покупать Виндовс? Фирменные программы часто защищены от бесплатного использования. А хроматографисты иногда хотят и дома поработать со своими хроматограммами. Что вообще можно сделать с помощью эксель? Даже простой экспорт хроматограммы или спектра уже будет мучителен. А попробуйте пик разметить и проинтегрировать! Есть ещё анализ спектральной чистоты пика. Конечно же обработка хроматографических данных, даже не трёхмерной, будет мучителен. Вообще Эксель - программа почти не пригодная ни для каких целей. |
||
|
vmu Пользователь Ранг: 1330 |
12.02.2019 // 20:38:15
gennadyrs, вы так пишете, будто я сказал, что эксель умеет печь пироги, и заставляю вас их печь в экселе. Нет, эксель не умеет печь пироги и еще много чего не умеет. Но кое-что умеет. В чем мучительность экспорта хроматограммы из хроматографического ПО в эксель? Хроматограмма - это ровно два столбца в таблице или простейший двумерный график, с рисованием которого эксель справится без проблем. Спектр - то же самое. Хроматограмма со спектрами - это уже таблица с множеством столбцов, но всего лишь таблица. Из нее в экселе проблематично сделать красивый 3D рисунок, но возможно визуализировать хроматограммы при разных m/z или длинах волн, либо извлечь спектры для заданых точек времени. Такую таблицу топикстартер вам прислал в виде csv-файла без всяких мучений. Понятно, что эксель не предназначен для разметки и удобного просмотра хроматограмм, но, если мне понадобится, то, не сомневайтесь, я в экселе размечу и проинтегрирую пик. |
||
|
SergeyK Пользователь Ранг: 2168 |
13.02.2019 // 8:52:35
Желаю ещё тогда обсудить с вами языки программирования, а также deb и rpm. Интересно, как быстро мы подеремся? |
| |
||
|
Ответов в этой теме: 22
|
||
| ЖУРНАЛ | ЛАБОРАТОРИИ | ЛИТЕРАТУРА | ОБОРУДОВАНИЕ | РАБОТА | КАЛЕНДАРЬ | ФОРУМ |
| Copyright © 2002-2022 «Аналитика-Мир профессионалов» |
|
Размещение рекламы / Контакты |
[]
