| Российский химико-аналитический
портал |
химический анализ и аналитическая химия в фокусе внимания ::: портал химиков-аналитиков ::: выбор профессионалов |
 |
|
| ANCHEM.RU » Форумы » 1. Аналитический форум ... |
 |
Выбор масс-спектрометра - протеомика, биомаркеры. >>>
|
 |
| Автор | Тема: Выбор масс-спектрометра - протеомика, биомаркеры. | ||
|
Gl Пользователь Ранг: 14 |
 10.08.2011 // 19:15:23
Выбираем масс-спектрометр для биолаборатории. Пока известно, что будет нужна идентификация и секвенирование белков, пептидов. Определение биомаркеров. Посттрансляционные изменения, конформации и изомеры. Возможно, что-то еще для развития. Бюджет еще формируется, пока предел неизвестен и нужно прикинуть цифры от и до. Нужен небольшой ликбез. Какой тип прибора лучше, в чем отличия для биоанализов, какие порядки цен на разные типы. Киньте ссылки, где почитать или расскажите в двух словах, пожалуйста. |
||
|
ANCHEM.RU Администрация Ранг: 246 |
|||
|
ion+ Пользователь Ранг: 2938 |
10.08.2011 // 19:45:47
Редактировано 1 раз(а) Пользователь удалил свое сообщение |
||
|
forum_reader Пользователь Ранг: 17 |
10.08.2011 // 19:48:49
На сегодняшний день в протеомике в основном используются два типа масс-спектрометров: MALDI-TOF и ESI. В идеальном варианте в протеомной лаборатории должно стоять хотя бы по одному прибору каждого типа. MALDI-TOF легче освоить и получить на нём, так желанные руководством, конкретные результаты. ESI масс-спектрометры представленный целой россыпью различных линеек, ионные ловушки, времяпролетные, троиные квадруполи и пр. В любом случае протеомный масс-спек это тандемная MS/MS (TOF/TOF) машина... Есть 5-6 всемирноизвестных производителей, предлагающих тандемные масс-спектрометры для протеомики. При выборе желательно обратить внимание на основные моменты: технические характеристики, цену, методическую поддержку и сервис в стране и в Вашем регионе особенно, и самое важное мнения Ваших коллег, у которых уже есть опять работы с такими системами в России... Насчет цен и характеристик лучше обращаться непосредственно к фирмам. Насчет всего остального - только коллеги... На вскидку в АЛФАВИТНОМ порядке производители: Agilent Bruker Sciex Shimadzu Thermo Waters |
||
|
ion+ Пользователь Ранг: 2938 |
10.08.2011 // 20:02:44
|
||
|
Gl Пользователь Ранг: 14 |
10.08.2011 // 20:05:09
Спасибо. Ионизация изначально предполагается ESI. Хотелось бы докупить к этому же прибору приставку MALDI, если возможно. По-вашему, получается, MALDI возможна только с TOF? То что надо тандемный прибор, это понятно. Я, собственно, хотел узнать поподробнее основы про различия типов TOF/TOF, Q/TOF, QTrap, 3Q, FT и др. в плане применения в протеомике и в плане порядка цен. Типа, это круто, но дорого, а это попроще и не позволяет делать вот это. Может где почитать обзор именно в плане технологий для протеомики? |
||
|
forum_reader Пользователь Ранг: 17 |
10.08.2011 // 21:05:50
Каждый производитель будет расхваливать именно свою линейку и приборы, от этого никуда не деться... есть ряд общеизвестных очевидных факторов, которые могут Вам помочь... Если говорить про MALDI, то эта технология работает эффективно только при глубоком вакууме, а это MALDI-TOF и только. Разрабтки MALDI интерфейсов, работающий при атмосферном давлении - это дополнительная фича некоторых брендов, но не более того... Большая часть работ по протеомике с использованием MALDI метода ионизации сделани именно на MALDI-TOF'ах. Это классика протеомики... Касательно ESI... FT-MS - это скорее уникальная игрушка, когда некуда деть деньги, да она обладает рядом суперских характеристик, но они избыточны для начинающей протеомной лаборатории, да и коллег в РФ ни так много, знакомых с данными системами ни на словах... 3Q (как и Qtrap'ы в большей степени) - это скорее машинки для скрининга известных компонентов... Ионные ловушки могут делать MS/MSn, да ионы копить... вообщем неплохая рабочая лошадка... Q-TOF'ы - данные MS/MS приборы получили широкое распространение за последние годы, в том числе и в протеомике, где зарекомендовали себя более чем отлично... TOF/TOF - это снова к разговору о MALDI... Дополнительно: обратитесь к фирмам-производителям - пусть они покажут Вам интересующий масс-спек в действии, проведут демонстрацию... обычно на демонстрации многие вопросы отпадают сами собой... в том числе и по сервису, что немаловажно в наших условиях... |
||
|
Каталог ANCHEM.RU Администрация Ранг: 246 |
|
||
|
Gl Пользователь Ранг: 14 |
10.08.2011 // 21:19:12
Спасибо. |
||
|
Spectrometrist Пользователь Ранг: 777 |
10.08.2011 // 21:36:55
Посмотрите эту ветку, там похожая проблема недавно обсуждалась: Не начинайте с прибора и тем более с фирмы, начинайте с биологической задачи и понимания аналитических методов. |
||
|
Gl Пользователь Ранг: 14 |
10.08.2011 // 22:31:15
Конечно я просмотрел что мог, прежде чем начинать тему. Но там они выбрали тип прибора и выбирали между фирмами. А вот как и почему они выбрали тип прибора? Биологическая задача на сегодня определена - идентификация биомаркеров. В том числе секвенирование и ПТМ. Хотелось бы максимум возможностей на перспективу. Собственно, в понимании аналитических методов и есть вопрос. Сейчас знакомимся с методами nanoESI-QTOF в лаборатории у коллег. Хочу узнать, что в мире MS есть другого для этих задач и насколько это лучше/хуже, дешевле/дороже. Можно тупо купить "то же, что у них", можно посмотреть, что бывает еще. |
||
|
Gl Пользователь Ранг: 14 |
10.08.2011 // 22:56:05
Вот из той ветки:
Мол веса? Идентификацию? Пост-трансляционные модификации? Да, все это надо. Количественный анализ пока не нужен, но может когда-нибудь понадобится относительный. Работа будет исследовательская. Хроматограф может и нужен стандартный. Изначально пробы будут биологически очищены. Разрешение - пока не понятно, но может и понадобится высокое для изомеров и ПТМ. Ну и как всегда, хочется прибор помощнее с запасом, тем более что пока потолок цены не определен, а область работ может быть и расширена под прибор. Вот, и какую выбирать ионизацию и тип прибора для этого? Выбирать между ESI-QTOF и MALDI-TOF/TOF? Или еще добавить ESI-Orbitrap и 3Q? Понятно, что теоретической подготовки не хватает и в форуме всего не подскажут, но все же... |
||
|
forum_reader Пользователь Ранг: 17 |
10.08.2011 // 22:57:23
Вот и начните с самого простого - помучайте коллег по поводу их прибора и его возможностей, постарайтесь собрать максимум информации о надежности, воспроизводимости на реальных образцах, сервисе и пр. Наверняка периодически наведываются сервисные инженеры... их попытайте... от них часто можно получить приличный объем объективной инфы... наверняка |
| |
||
| ЖУРНАЛ | ЛАБОРАТОРИИ | ЛИТЕРАТУРА | ОБОРУДОВАНИЕ | РАБОТА | КАЛЕНДАРЬ | ФОРУМ |
| Copyright © 2002-2022 «Аналитика-Мир профессионалов» |
|
Размещение рекламы / Контакты |
[]
