Форумы ANCHEM.RU: Количественная оценка пиков хроматограммы в отсутствии стандартов

Российский химико-аналитический портал

химический анализ и аналитическая химия в фокусе внимания ::: портал химиков-аналитиков ::: выбор профессионалов

карта портала ::: расширенный поиск

ANCHEM.RU » Форумы » 1. Аналитический форум ...

Форум химиков-аналитиков, аналитическая химия и химический анализ.

Количественная оценка пиков хроматограммы в отсутствии стандартов >>>

Ответов в этой теме: 6

[ Ответ на тему ]

Автор

Тема: Количественная оценка пиков хроматограммы в отсутствии стандартов

Кирилл
Пользователь
Ранг: 40

20.03.2006 // 14:09:51

Задача - определить чистоту пептида. Референцев, естественно нет.
Понятно, что оценку можно делать по проценту площади пиков, однако встает вопрос о том, по какому критерию отсекать шум, дабы исключить его влияние на результат. Существуют ли какие-то приемы для этого?
Как вообще решают такую задачу.
Холостая хроматография дает практически идеально ровную линию.
Заранее всем спасибо!

ANCHEM.RU
Администрация
Ранг: 246

bf109xxl
Пользователь
Ранг: 1727

20.03.2006 // 16:33:41

Ссылка:
Second-Order Peak Detection for Multicomponent High-Resolution LC/MS Data
Anal.Chem. 2006, 78, 975-983

В статье есть ссылка на программную реализацию предлагаемого алгоритма в виде компилированного под Matlab кода:
www.anchem.su.se/peakd

Кирилл
Пользователь
Ранг: 40

21.03.2006 // 14:00:47

Ссылка не открывается

bf109xxl
Пользователь
Ранг: 1727

21.03.2006 // 14:53:00

Редактировано 1 раз(а)

Вчера еще открывалась.
В данный момент, похоже, есть проблемы во внутренней сетке Стокгольмского университета, сервер отдела аналитической химии вообще недоступен. Надо просто подождать.

Кирилл
Пользователь
Ранг: 40

22.03.2006 // 16:12:57

Открылась ссылка,спасибо, почитаю.
Еще вопрос в догонку по теме - сильно ли влмияет на результат различие в экстинции для веществ, выходящих в разных пиках?

bf109xxl
Пользователь
Ранг: 1727

22.03.2006 // 18:19:09

Зависит от длины волны. На 280 нм различия довольно большие - количество аминокислот с ароматическими группами может сильно варьироваться. А вот на 214 нм теоретически можно было бы померять. Но честно признаюсь - мы всегда пользуемся стандартами, посему применимость такого метода не оценивали.

Каталог ANCHEM.RU
Администрация
Ранг: 246

Газовый хромато-масс-спектрометр Thermo Fisher Scientific ISQ™
ГХ/МС Thermo Scientific ISQ™ - это прибор, обладающий не только самыми высокими аналитическими параметрами, но и cамой высокой устойчивостью к загрязнениям. ISQ™ может комплектоваться одноканальным газовым хроматографом Thermo Scientific FOCUS GC или Thermo Scientific TRACE GC ULTRA.

[ Информация из каталога оборудования ANCHEM.RU ]

G.Baram
VIP Member
Ранг: 211

22.03.2006 // 22:56:14

Редактировано 1 раз(а)

Кирилл пишет:
Еще вопрос в догонку по теме - сильно ли влмияет на результат различие в экстинции для веществ, выходящих в разных пиках?

Количественную оценку поглощения пептида с известным набором аминокислот при длинах волн 210, 220, 230, 240, 250, 260, 280 и 300 нм можно сделать по методике, описанной в статье:
И.Н.Азарова, Г.И.Барам, Е.Л.Гольдберг. Предсказание объемов удерживания и УФ спектров пептидов в обращенно-фазовой ВЭЖХ. Биоорганическая химия, 2006, т.32, №1, сс.56-63


Ответов в этой теме: 6	Ответ на тему

ПОСЛЕДНИЕ НОВОСТИ ANCHEM.RU: [ Все новости ]

Размещение рекламы / Контакты