| Российский химико-аналитический
портал |
химический анализ и аналитическая химия в фокусе внимания ::: портал химиков-аналитиков ::: выбор профессионалов |
 |
|
| ANCHEM.RU » Форумы » 1. Аналитический форум ... |
 |
LC-MS/MS(q/q) peptide identification. >>>
|
 |
| Автор | Тема: LC-MS/MS(q/q) peptide identification. | |||||
|
virtu VIP Member Ранг: 2135 |
 28.05.2009 // 12:28:02
Нужны советы "практического" характера. Если кто занимался (-ется) буду признателен за отклик (e-mail) Пептиды: 5-10 АК. Модифицированные (по однотипной функциональной группе). С уважением, Алексей. |
|||||
|
ANCHEM.RU Администрация Ранг: 246 |
||||||
|
Spectrometrist Пользователь Ранг: 777 |
28.05.2009 // 16:55:52
Редактировано 1 раз(а) А в чем именно проблема? В принципе, мы это делаем, среди других анализов. Только не понятно, что значит q/q в этом контексте. И, вам нужно идентифицировать модифицированные пептиды среди немодифицированных? |
|||||
|
ISafon Пользователь Ранг: 9 |
28.05.2009 // 17:22:24
Добрый день коллеги. Прошу прощения за то. что не отвечаю, а обращаюсь с вопросом. Но LC/МS меня тоже очень интересует. Я занимаюсь фитохимией - конкретно спиртовыми экстрактами. Я увидела Ваши слова "мы этим (LC/МS ) занимаемся" и прошу помощи. Можно ли проанализировать мои спиртовые экстракты. Если да то за почем и как Вас найти. Мой E-mail ISafon{coбaчkа}yandex.ru |
|||||
|
Spectrometrist Пользователь Ранг: 777 |
28.05.2009 // 17:35:43
Охотно помогу советом, литературой, методиками. Но делать сервис-анализы не сможем. |
|||||
|
ISafon Пользователь Ранг: 9 |
28.05.2009 // 21:37:37
Cпасибо, что ответили. Очень жаль , что не сможете. Я бы с удовольстием и большим интересом все анализы делала бы сама, но в нашем городе нет прибора. Но если вдруг мне удастся в какой-либо лаборатории что-либо сделать, и вдруг / не дай бог/ возникнут вопросы, не удивляйтесь, если я возникну со своими вопросами. А может у Вас ситуация изменится??? Я обычную ВЭЖХ сделала, пиков более 60, а стандартов только 20..... Поэтому продолжаю кричать о помощи. |
|||||
|
virtu VIP Member Ранг: 2135 |
29.05.2009 // 16:45:28
to Spectrometrist: Спасибо за отклик. Проблемы нет - нужны советы "практического" характера. Меня интересует алгоритм идентификации - ПО, информационная поддержка и т.д. Я так понимаю, что в базах модифицированных нет. Да, нужно именно это. Оставьте пож-та свой e-mail или напишите что-то на utriv{coбaчkа}mail.ru или virtulc{coбaчkа}gmail.com З.Ы.: q/q = quadrupole/quadrupole С уважением, Алексей. |
|||||
|
Каталог ANCHEM.RU Администрация Ранг: 246 |
|
|||||
|
Spectrometrist Пользователь Ранг: 777 |
29.05.2009 // 18:02:06
Редактировано 1 раз(а) Алгоритмы и т.д. это большая тема, для начала рекомендую: Forner, F., Foster, L.J. and Toppo, S. (2007) Mass spectrometry data analysis in the proteomics era. Current Bioinformatics, 2, 63-93. Это складно написанныей обзор, вполне достаточно для "озанкомительного чтения". Если вам до него не добраться, дайте мне знать, выложу где нибудь. q/q - этой не triple quadrupole имеется ввиду? Для него лучше без LC, банально наноспреем, но не очень эффективно Wilm, M., Neubauer, G. and Mann, M. (1996) Parent ion scans of unseparated peptide mixtures. Anal Chem, 68, 527-533. Если это "хороший" новый трипл квад, лучше делать inclusion lists and МRM, тогда LC подойдет очень хорошс. Но это если в нескольких белках (а лучше в одном), а не на сложной смеси. |
|||||
|
virtu VIP Member Ранг: 2135 |
29.05.2009 // 20:11:33
Спасибо за ссылки. Изучаю. Вектор понятен. Да, triple quadrupole (просто руки "не поворачиваются" так писать). |
|||||
|
Spectrometrist Пользователь Ранг: 777 |
29.05.2009 // 20:43:05
тогда более корректно QqQ, где Q традиционно обозначают аналитический, а q RF-only квадруполь (= collision cell). |
| |
||
|
Ответов в этой теме: 8 |
||
| ЖУРНАЛ | ЛАБОРАТОРИИ | ЛИТЕРАТУРА | ОБОРУДОВАНИЕ | РАБОТА | КАЛЕНДАРЬ | ФОРУМ |
| Copyright © 2002-2022 «Аналитика-Мир профессионалов» |
|
Размещение рекламы / Контакты |
[]
