| Российский химико-аналитический
портал |
химический анализ и аналитическая химия в фокусе внимания ::: портал химиков-аналитиков ::: выбор профессионалов |
 |
|
| ANCHEM.RU » Форумы » 1. Аналитический форум ... |
 |
Разложение хроматографических пиков по форме >>>
|
 |
| Автор | Тема: Разложение хроматографических пиков по форме | ||
|
Kalambet Пользователь Ранг: 484 |
 26.01.2007 // 17:28:05
Маленько напряглись и сварганили разложение неполностью разделенных пиков по форме. Варианты формы - Гаусс, Экспоненциально модифицированный Гаусс или отдельно стоящий пик из той же хроматограммы (в перспективе - из файла). Можно разлагать пики, один из которых зашкален или пытаться восстановить параметры (площадь/высота) зашкаленных пиков. Ищем добровольцев, желающих пожертвовать своим временем для испытыний этого безобразия (а заодно и проверяем кому оно ... нужно). Требования - чтоб МультиХром у жертв был. |
||
|
ANCHEM.RU Администрация Ранг: 246 |
|||
|
bf109xxl Пользователь Ранг: 1727 |
26.01.2007 // 18:25:03
Редактировано 5 раз(а) А шо тут такого варганить? Штука известная, делается с помощью PeakFit или (попроще) PeakFittingModule в Origin'е (можно и еще несколько софтин назвать навскидку). Про специфику хроматографических данных можно почитать у Фелингера "Data Processing in Chromatography". Там про форму и разделение пиков много чего написано. А в чем проблема сгенерить тестовые данные? Ну, наваять пиков с перекрытием, наложить шум... Или я чего-то не догоняю? Беда в том, что форма одного и того же пика зачастую плохо воспроизводится. Кстати, какой алгоритм применяли для разделения? Марквардт? Пики ищутся автоматически или вручную? Форма пиков задается для каждого отдельно или как? Или делали обратную свертку с регуляризацией? Или непараметрические методы? Или, может, модные ноне вейвлеты?  В общем, хоть я и не хроматографист, но тема мне лично интересная, буду признателен за подробности. 
|
||
|
Дмитрий (anchem.ru) Администратор Модератор форума Ранг: 4460 |
27.01.2007 // 18:54:47
Юрий Анатольевич, это по наработкам Димы из лаборатории Ревельского? Или своя разработка? Насколько я помню, там целая диссертация была с опробированием на пионе
|
||
|
knoxchem Пользователь Ранг: 515 |
27.01.2007 // 21:35:16
Поддерживаю bf109xxl Всё уже давно сделано. И PeakFit замечательная программка. Ей, кстати, упоминавшийся Фелингер, пользуется. можно гнуплотом, можно маткадом, можно для ориджина чего-нить написать. |
||
|
bf109xxl Пользователь Ранг: 1727 |
28.01.2007 // 12:04:58
Сделано очень многое, но далеко не все. Методов разделения пиков очень много, проблема в выборе оптимального в каждом конкретном случае, плюс, устойчивость к зашумленности сигнала. Софт, который указывался выше, ну, тот же PeakFit - небесплатный, более того, недешевый, поэтому появление дополнительных модулей, качественно выполняющие разделение перекрывающихся пиков, появятся в стандартном хроматографическом софте, можно только приветствовать. Поэтому мне и было бы интересно узнать, какой конкретно метод использовался. Так уже усё давно написано! Peak Fitting Module (PFM) - вполне рабочая вещь.
|
||
|
knoxchem Пользователь Ранг: 515 |
28.01.2007 // 15:59:37
Мне кажется, что софт для обработки данных в аналитической хроматографии не должен содержать избыточных функций. Это усложняет интерфейс и путает неподготовленного пользователя*. Если мне понадобится провести анализ по неразделённым пикам, я буду пользоваться простейшими методами: или калибровать по высоте каждого или «наездником», если малый пик на хвосте. Если возникает задача восстановления формы пиков для неаналитических целей, для расчётов двухкомпонентных равновесий, разработки техпроцессов, то здесь я буду пользоваться собственными алгоритмами или спецпрограммами, возможности которых шире, чем потенциальные возможности дополнительного модуля к хромсофту (со всем уважениям к его разработчикам). В таких случаях от хромсофта мне нужен только файл оцифрованной хроматограммы в стандартном формате данных txt or csv. Вот чего, кстати, не было в Мультихроме, когда я им пользовался много лет назад. Надеюсь, сейчас ввели такую возможность. *Неподготовленный пользователь – это обычный аналитик, который подготовлен для выполнения рутинных хроматографических анализов, а специальной хроматографической грамоте не обучен. Таких пользователей 95% (а может и 99%). Не стоит осложнять им жизнь. Порой это даже опасно. Бездумное использование метода, основ которого пользователь не знает, а следовательно, не знает его ограничений, может привести к ошибкам. |
||
|
Каталог ANCHEM.RU Администрация Ранг: 246 |
|
||
|
bf109xxl Пользователь Ранг: 1727 |
28.01.2007 // 21:28:41
Избыточность данной функции спорна. Математическое разделение пиков значительно повышает точность определения площади пика. Пользователя никто не принуждает использовать эту функцию. Кому не надо - просто игнорирует. Ну а кому-то захочется большей точности. В любом случае, требуется время для осознания необходимости и воспитания привычки у пользователей. Но начинать-то когда-то надо... Это совсем другая задача. Вот и показать ему пару дополнительных кнопок. Разделение пиков не требует каких-то особых знаний у конечного пользователя. Просто чуть больше пунктов в алгоритме действий. PS. Неправильно указал название книги Фелингера: "Data Analysis and Signal Processing in Chromatography" |
||
|
Lucap Пользователь Ранг: 110 |
28.01.2007 // 23:41:47
По моему глубокому убеждению от софта для обработки данных требуются только две вещи - площадь пика и время его выхода. С этой точки зрения предлагаемая функция не является избыточной, т.к. позволяет получить площадь там, где ее нельзя получить обычными методами. Поэтому записываюсь в число добровольцев - испытателей. vsm at tut dot by |
||
|
Igor Sit Пользователь Ранг: 150 |
29.01.2007 // 12:42:27
- аналогично...
|
||
|
DSP007 VIP Member Ранг: 2228 |
29.01.2007 // 13:54:47
Уважаемый Kalambert Скиньте обновление на petrishev{coбaчkа}regmed.ru Отдам девчонкам, пусть шимадзу мучают. PS . А куда ответ писать? |
||
|
Kalambet Пользователь Ранг: 484 |
29.01.2007 // 14:33:49
Значит, все-таки шансы есть. У меня, по правде говоря, были сомнения. Относительно оригинальности - писали свое. Работа Димы то ли проскочила мимо, то ли не обратил внимания - буду благодарен за ссылки. Феллингера штудировали весьма внимательно, у него разделение основано на Фурье, мы пробовали решить задачу без Фурье. Проблема была в формулах, описывающих этот самый ЭМГ - из-за вычислительных свойств той, что приведена у Феллингера или в хелпе от PeakFit'а пришлось переоткрывать Америку и писать другую формулу. Потом ее обнаружили у Delley, и в завуалированном виде у Феллингера (3.113). Понятно, что во всех случаях оптимизации пиков варьируются положение и высота. Форма ЭМГ у каждого пика своя (свои тау и сигма), у Гаусса может быть как своя сигма, так и одинаковая для всех гауссов или пропорционально времени. Большая просьба всем заинтересованным выслать мне на kalambet{coбaчkа}ampersand.ru номера HASPов или АЦП, смотря у кого на чем стоит ключ активации. Этот номер можно посмотреть в Справка/О Программе |
| |
||
| ЖУРНАЛ | ЛАБОРАТОРИИ | ЛИТЕРАТУРА | ОБОРУДОВАНИЕ | РАБОТА | КАЛЕНДАРЬ | ФОРУМ |
| Copyright © 2002-2022 «Аналитика-Мир профессионалов» |
|
Размещение рекламы / Контакты |
[]
