Форумы ANCHEM.RU: Triple quads в фармакологии: начало конца?

Российский химико-аналитический портал

химический анализ и аналитическая химия в фокусе внимания ::: портал химиков-аналитиков ::: выбор профессионалов

карта портала ::: расширенный поиск

ANCHEM.RU » Форумы » 1. Аналитический форум ...

Форум химиков-аналитиков, аналитическая химия и химический анализ.

Triple quads в фармакологии: начало конца? >>>

  Ответов в этой теме: 62
  Страница: 1 2 3 4 5 6 7
  «« назад || далее »»

[ Ответ на тему ]

Islander
VIP Member
Ранг: 1065

17.12.2008 // 16:47:03

AlexGr пишет:
To Islander:
Подскажите пожалуйста, когда Вам инсталлируют новое оборудование (в частности любую систему LC-MS), как выглядит процедура проверки заявленной производителем чувствительности? Это вопрос возник т.к. у нас ТЗ указано 1 fmol при 1:10 S/N и сервис инженер пытается это получить в пересчете на поток и накопление в октополе.
Какая чувствительность у такого класса оборудования (TQ) на самом деле (например, в пересчете на мкг/мл). Понятно, что все очень зависит от соединений, но в среднем, сколько?

Во-первых, не понятно, что значит 1 fmol при 1:10 S/N. 1 fmol чего? При каких условиях? Вот как это звучит, например, у Thermo в спецификации на Vantage:

Sensitivity
Electrospray (HESI) at Unit Resolution
A 5 μL injection of a 100 fg/μL (0.3250 fmol/μL) reserpine solution at a flow rate of 500 μL/min 30:70:0.1 water/Acetonitrile/Formic acid will produce a minimum signalto-noise ratio of 500:1 for the transition of the protonated molecule at m/z 609.3 to the fragment ion at m/z 195.1 when operated in selected reaction monitoring mode (SRM) with Q1 and Q3 resolution set to 0.7 daltons (Da) FWHM.

www.thermo.com/eThermo/CMA/PDFs/Articles/articlesFile_6905.pdf

Здесь все четко и никакой возможности для разночтений. Это для TQ топ класса.

Во-вторых, в качестве модельного вещества и Термо, и АБ используют резерпин. А что такое "в среднем", мне не понять. Это все равно, что средняя температура по больнице. Вместе с моргом...

ANCHEM.RU
Администрация
Ранг: 246

Spectrometrist
Пользователь
Ранг: 777

17.12.2008 // 17:02:58

А как они шум меряют в таком эксперименте, они видят сигнал когда TIC стабилизируется, но ведь не шум сам по себе? К тому же шум, по определению там очень маленький (SRM ведь как никак), и малые случайные флуктуации шума дадут гигантский скачок в S/N. А если в разных экспериментах - типа, два независимых ввода, скажем резерпин (или что там) и растворитель, я могу сделать S/N какое угодно, хоть 1: 1Е06, только spray чуть "подправить".

Islander
VIP Member
Ранг: 1065

17.12.2008 // 17:46:53

Spectrometrist пишет:
А как они шум меряют в таком эксперименте, они видят сигнал когда TIC стабилизируется, но ведь не шум сам по себе? К тому же шум, по определению там очень маленький (SRM ведь как никак), и малые случайные флуктуации шума дадут гигантский скачок в S/N. А если в разных экспериментах - типа, два независимых ввода, скажем резерпин (или что там) и растворитель, я могу сделать S/N какое угодно, хоть 1: 1Е06, только spray чуть "подправить".

Делаются 5мкл заколы в поток 500мкл/мин, состав указан. Шум измеряется между заколами - он вполне измеряем на таких потоках. Для статистики делается несколько заколов.

Spectrometrist
Пользователь
Ранг: 777

17.12.2008 // 18:04:09

Понятно, т.е. там LC и кран должен стоять? И S/N надо смотреть в максимуме пика, так? - если всего 5 мкл колоть, то на плато сигнал не выйдет при потоке 0.5 мл/мин.

Вообще более интуитивно было бы закачивать резерпин в flow injection шприцем и ждать выхода сигнала на плато, а шум брать где-то впереди пока сигнал не начал лезть вверх. Но как то сложно, надо же еще и спрей стабилизировать успеть, т.е. пара мл должна сидеть в "мертвом об'еме"

Islander
VIP Member
Ранг: 1065

17.12.2008 // 18:16:59

Spectrometrist пишет:
Понятно, т.е. там LC и кран должен стоять? И S/N надо смотреть в максимуме пика, так? - если всего 5 мкл колоть, то на плато сигнал не выйдет при потоке 0.5 мл/мин.

Совершенно верно, это позволяет смоделировать в какой-то мере реальную чувствительность в условиях LC/MS. Ведь в хроматографическом пике сигнал на плато тоже не выходит. Да и грубо сравнивать разные приборы от разных производителей при таком подходе тоже сподручнее...

Каталог ANCHEM.RU
Администрация
Ранг: 246

Лаборатория стереохимии сорбционных процессов (ЛССП) ИНЭОС РАН
Анализы различных классов соединений (органический синтез, биотехнология, загрязнения почвы, воды, анализ энантиомерного состава) методами ВЭЖХ и ГХ.

AlexGr
Пользователь
Ранг: 71

19.12.2008 // 13:12:09

Islander пишет:
Sensitivity
Electrospray (HESI) at Unit Resolution
A 5 μL injection of a 100 fg/μL (0.3250 fmol/μL) reserpine solution at a flow rate of 500 μL/min 30:70:0.1 water/Acetonitrile/Formic acid will produce a minimum signalto-noise ratio of 500:1 for the transition of the protonated molecule at m/z 609.3 to the fragment ion at m/z 195.1 when operated in selected reaction monitoring mode (SRM) with Q1 and Q3 resolution set to 0.7 daltons (Da) FWHM.

Спасибо.
Varian тоже приводит свои значения чувствительности по резерпину (согласен, нужно было сразу конкретизировать). Но в отличие от Thermo: 1fmol резерпина при S/N 10:1 и все (!!!) больше никаких условий анализа. Т.к. это значение не особо полезно в реальных исследованиях, то хотелось узнать настоящие характеристики хороших приборов.
100 fg/μL при

Islander
VIP Member
Ранг: 1065

19.12.2008 // 14:23:15

AlexGr пишет:
Varian тоже приводит свои значения чувствительности по резерпину (согласен, нужно было сразу конкретизировать). Но в отличие от Thermo: 1fmol резерпина при S/N 10:1 и все (!!!) больше никаких условий анализа.

Вы имеете полное право запросить условия определения чувствительности у фирмы. И вообще, разве не их специалист производит пуско-наладку?

AlexGr
Пользователь
Ранг: 71

19.12.2008 // 15:13:20

Islander пишет:

AlexGr пишет:
Varian тоже приводит свои значения чувствительности по резерпину (согласен, нужно было сразу конкретизировать). Но в отличие от Thermo: 1fmol резерпина при S/N 10:1 и все (!!!) больше никаких условий анализа.
Вы имеете полное право запросить условия определения чувствительности у фирмы. И вообще, разве не их специалист производит пуско-наладку?

Специалист конечно из Variana, но он на многие наши вопросы по оборудованию и по софту ответить не может....
А тест чувствительности он провел следующим образом: без LC (в нашем случае Agilent 1200) набрал шприц с резерпином 60мкг/л (~100fmol/mkl), 50:50:0.1 CN/water/Formic A, установил скорость 1 мкл/мин., в октополе копил 1s, получил сигнал. После пересчитал на время накопления (100fmol:60s=~1.6fmol).
Как Вы считаете, можно ли доверять таким данным?
У меня так они вызывают большооое сомнение.

Islander
VIP Member
Ранг: 1065

19.12.2008 // 16:37:52

Редактировано 1 раз(а)

AlexGr пишет:
Специалист конечно из Variana, но он на многие наши вопросы по оборудованию и по софту ответить не может....

Как Вы считаете, можно ли доверять таким данным?

Если сигнал копить (т.е. усреднять) то отношение сигнал/шум можно получить сколь угодно большое - это лишь вопрос времени... Хотя тут, я так понимаю, ограничение по общему количеству введенного вещества. Но практической значимости в этом тесте я не вижу.
Настоятельно советую запросить разъяснения у специалистов непосредственно на фирме, а не в местном представительстве.

AlexGr
Пользователь
Ранг: 71

19.12.2008 // 18:10:25

Islander пишет:
Настоятельно советую запросить разъяснения у специалистов непосредственно на фирме, а не в местном представительстве.

Запросили. Надеюсь получим в скором времени.


Ответов в этой теме: 62 Страница: 1 2 3 4 5 6 7 «« назад \|\| далее »»	Ответ на тему

ПОСЛЕДНИЕ НОВОСТИ ANCHEM.RU: [ Все новости ]

Размещение рекламы / Контакты