| Российский химико-аналитический
портал |
химический анализ и аналитическая химия в фокусе внимания ::: портал химиков-аналитиков ::: выбор профессионалов |
 |
|
| ANCHEM.RU » Форумы » 1. Аналитический форум ... |
 |
Может ли IonTrap заменить qTOF? >>>
|
 |
| Автор | Тема: Может ли IonTrap заменить qTOF? |
|
Chamomillablue Пользователь Ранг: 1302 |
 02.12.2013 // 3:17:34
И снова вынужден обратиться с вопросом. Недавно поставили нам железку HPLC с ионной ловушкой Amazon Speed ETD. Убеждали, что если её доукомплектовать блоками ESI/APCI, то она сможет решать не только протеомные задачи, но и многие другие, как бы намекая, что qTOF уже и не нужен будет... Действительно ли это так? |
|
ANCHEM.RU Администрация Ранг: 246 |
|
|
virtu VIP Member Ранг: 2136 |
02.12.2013 // 12:14:06
Да, можно будет решать и другие задачи, но, очевидно, что данное железо не способно заменить QqTOF, особенно по точности измерения m/z и разрешению (если мы говорим о современных QqTOF). З.Ы.: Данное железо (Bruker Amazon speed) очень достойное, сам когда-то на него смотрел. |
|
Chamomillablue Пользователь Ранг: 1302 |
02.12.2013 // 13:16:34
Редактировано 2 раз(а) Как вы думаете, есть смысл докупить пару этих блоков (это вполне высоковероятно даже силами грантов) или всё-таки капать на моск начальству и требовать HPLC-ESI/APCI-QqTOF, мотивируя тем, что химера на базе Amazon недостаточно эффективна? Тезис про пониженную точность измерения m/z мне не совсем понятен... ведь если Amazon позволяет разделить Lys/Gln или Met(ox)/Phe, значит, с точностью всё в порядке, по крайней мере, для уровня задач по секвенированию белков... не? |
|
Spectrometrist Пользователь Ранг: 777 |
02.12.2013 // 21:32:17
Редактировано 1 раз(а) "...в танце намекая это вовсе не банан" (с) сорри, не qtof. ESI не блок, а ионый источник electrospray ionization. Как они протеомикс то делают без электроспрея? - что ж там доукомплектовывать? Конечно, как всякий масс спек он чего то будет мерить и как то работать. Но с протеомиксом сравнивать ваши задачи не надо, просто хотя бы потому что в пептидах легко валится каждая пептидная связь да еще и тремя спосбами (правда, один интенсивный); в small molecules такой роскоши нет, желательно понимать и учитывать каждый интенсiвный ион. 99% протеомных задач сводятся к поiску нескольких пептидов в датабазе, поэтому там скорость важнее качества и трэпы давно и успешно работают: чувствительны, неубиваемы, быстры и дешевы (относительно). А то что разрешения нет и точность масс +/- 0.25 Th то это скомпенсируется скоростью и обилием пиков в слектре. И это реально так. А вот с малыми молекулами все сильно иначе. И в догонку, не забудьте 1/3 rule: в трэпе вы не увидите ионов ниже 1/3 фрагментированного m/z |
| |
||
|
Ответов в этой теме: 3 |
||
| ЖУРНАЛ | ЛАБОРАТОРИИ | ЛИТЕРАТУРА | ОБОРУДОВАНИЕ | РАБОТА | КАЛЕНДАРЬ | ФОРУМ |
| Copyright © 2002-2022 «Аналитика-Мир профессионалов» |
|
Размещение рекламы / Контакты |
[]
