Российский химико-аналитический портал  химический анализ и аналитическая химия в фокусе внимания ::: портал химиков-аналитиков ::: выбор профессионалов  
карта портала ::: расширенный поиск              
 



ANCHEM.RU » Форумы » 4. Химический форум ...
  4. Химический форум | Список форумов | Войти в систему | Регистрация | Помощь | Последние темы | Поиск

Форум химиков-аналитиков, аналитическая химия и химический анализ.

Как правильно обозвать вещество и на что ссылаться? >>>

  Ответов в этой теме: 16
  Страница: 1 2
  «« назад || далее »»

[ Ответ на тему ]


Автор Тема: Как правильно обозвать вещество и на что ссылаться?
Chamomillablue
Пользователь
Ранг: 1204

02.08.2017 // 14:42:21     
Добрый день!

Дано: sn-1,2-диацилглицерин (ДАГ) и Ацетил-КоА, фермент присоединяет последний к первому и получается sn-1,2-диацил-3-ацетил-глицерин. По факту, происходит реакция ацетилирования ДАГ, т.е. образуется АсДАГ, но он же может считаться и триацилглицерином (технически).

Сегодня из редакции одного журнала на нашу статью прислали рецензию, в которой рецензент пишет:

"I believe these molecules should be referred to as acTAG or acetyl-TAG because from a chemical perspective they are triacylglycerols (i.e. three acyl groups - acetate being the shortest acyl group - esterified to a glycerol backbone) and lack the important free hydroxyl group that is present in the glycerol backbone of DAG. From a biological perspective, these molecules are synthesized and function in a similar manner to the typical TAG found in most plants. Referring to them as a modified DAG (i.e. acDAG) implies a completely different suite of chemical properties and biological function".

Логика подсказывает, что у ТАГ нет никаких вакантных положений, которые могут быть ацетилированы, чтобы он назывался ацетилированным триацилгицерином.

Что на этот счёт говорит органическая химия? Какое из этих названий корректно?
Спасибо!
Реклама на ANCHEM.RU
Администрация
Ранг: 246
Размещение рекламы
smihаilоv
Пользователь
Ранг: 3137


02.08.2017 // 15:34:46     
Думаю, что на этот вопрос более квалифицировано Вам ответят на этом форуме www.chemport.ru/forum/viewforum.php?f=9
Chamomillablue
Пользователь
Ранг: 1204


02.08.2017 // 16:54:36     

smihаilоv пишет:
Думаю, что на этот вопрос более квалифицировано Вам ответят на этом форуме www.chemport.ru/forum/viewforum.php?f=9

Спасибо!
Chamomillablue
Пользователь
Ранг: 1204


02.08.2017 // 19:45:31     
В IUPAC (IUPAC-IUB Commission on Biochemical Nomenclature (CBN) Nomenclature of Lipids / Recommendations, 1976) написано следующее:

Lip-1.2. 'Neutral fats' are mono-, di-, or triesters of glycerol with fatty acids, and are therefore termed monoacylglycerol, diacylglycerol, or triacylglycerol, as appropriate. 'Acylglycerols' includes mixtures of any or all of these.

Comments. (a) The term 'acyl' is used in Organic Nomenclature [3] to denote the radical formed by loss of the OH group from the acid function of any acid (cf. Lip-1.6). We are concerned here with acyl radicals of aliphatic carboxylic acids with four or more carbon atoms, the larger members of which (> C10) are also known as 'higher fatty acids'.

Получается, что ацетатный остаток нельзя считать ацилом, соответственно, и нельзя считать триацилглицерином то, что его содержит?
абр
Пользователь
Ранг: 787


03.08.2017 // 10:14:11     
Сдается мне, что рецензент просто предлагает назвать ваш acDAG acTAG-ом
Chamomillablue
Пользователь
Ранг: 1204


03.08.2017 // 10:40:18     
Редактировано 1 раз(а)


абр пишет:
Сдается мне, что рецензент просто предлагает назвать ваш acDAG acTAG-ом
Ну да, но корректно ли это? ИЮПАК говорит, что не очень, как я понимаю
Реклама на ANCHEM.RU
Администрация
Ранг: 246
Размещение рекламы
ЦКП-ИАСЦ ОАО «Государственный научно-исследовательский и проектный институт редкометаллической промышленности «Гиредмет» ЦКП-ИАСЦ ОАО «Государственный научно-исследовательский и проектный институт редкометаллической промышленности «Гиредмет»
Оказание услуг в сфере диагностики, сертификации, стандартизации и метрологического обеспечения производства перспективных материалов на основе редких, цветных и драгоценных металлов, высокочистых веществ и полупроводников, минерального и вторичного сырья, полупродуктов, сплавов и пр.
абр
Пользователь
Ранг: 787


03.08.2017 // 11:19:15     
Редактировано 2 раз(а)

acDAG тоже не совсем корректно.
Но это те сокращения, которые вы употребляете в статье для удобства обсуждения, если я правильно понимаю. Если это так, то и ваш вариант, и вариант рецензента практически равноправны и это не вопрос ИЮПАК номенклатуры. Можете согласиться с рецензентом, а можете отстаивать свой способ записи.
ПМСМ, есс-но.
Chamomillablue
Пользователь
Ранг: 1204


03.08.2017 // 12:05:11     

абр пишет:
acDAG тоже не совсем корректно.
Но это те сокращения, которые вы употребляете в статье для удобства обсуждения, если я правильно понимаю. Если это так, то и ваш вариант, и вариант рецензента практически равноправны и это не вопрос ИЮПАК номенклатуры. Можете согласиться с рецензентом, а можете отстаивать свой способ записи.
ПМСМ, есс-но.


А почему АсДАГ не совсем корректно? Ведь ИЮПАК вполне конкретна в формулировке: под ТАГ понимается глицерин, этерифицированный ацилами ЖК, а под ацилами ЖК биохимическая комиссия ИЮПАК понимает то, что больше 4 углеродных атомов... я совсем запутался ))
абр
Пользователь
Ранг: 787


03.08.2017 // 13:51:29     
Редактировано 1 раз(а)

Потому что DAG и TAG означают, прежде всего, дважды и трижды ацилированный глицерин. Правильно? Поэтому ваш acDAG понят рецензентом именно как диацилглицерин, в котором один из ацилов = ацетил. Но, ПМСМ, в тексте статьи вы можете употреблять такое сокращение (если убедите рецензента ). Другой вариант - присвойте вашему DAG-у номер. И смело пишите ас-9 или ас-IX.
Chamomillablue
Пользователь
Ранг: 1204


03.08.2017 // 14:06:16     

абр пишет:
Потому что DAG и TAG означают, прежде всего, дважды и трижды ацилированный глицерин. Правильно? Поэтому ваш acDAG понят рецензентом именно как диацилглицерин, в котором один из ацилов = ацетил. Но, ПМСМ, в тексте статьи вы можете употреблять такое сокращение (если убедите рецензента ). Другой вариант - присвойте вашему DAG-у номер. И смело пишите ас-9 или ас-IX.

Если коротко о фабуле нашей статьи, то мы, отталкиваясь от того, что про эти соединения пишут, якобы у них ацетат находится при альфа-атоме (1 или 3), следовательно, можно было бы ожидать, в случае рацемической смеси изомеров, расщепление сигнала от СН3-СOO на 2 протона при крайних углеродах глицеринового скелета. С помощью двумерной ЯМР (HMBC) мы показали, что этого нет, значит, ацетат только в одном крайнем атоме, чей химсдвиг принято соотносить с sn-3-положением, а потому с химической тз правильно говорить об sn-1,2-диацил-3-ацетил-глицерине, т.е. об ацетилированном ДАГе, так что, не уверен, что рецензент понял это как ДАГ где 1 ацил от ЖК, а второй -- от ацетата (ведь в этом случае уже уместно говорить об ацетилированном моноацил-глицерине).
В общем, попробую в ответе рецензенту изложить позицию со ссылкой на ИЮПАК и оставить вопрос на усмотрение главного редактора, который в нашей рукописи числится как SAE.
virtu
VIP Member
Ранг: 2063


03.08.2017 // 16:07:18     

Chamomillablue пишет:
Получается, что ацетатный остаток нельзя считать ацилом, соответственно, и нельзя считать триацилглицерином то, что его содержит?
А чем же его тогда считать? Согласен с позицией выше (т.е. без разницы, главное, чтобы "в Багдаде было всё спокойно"). В принципе, если возвращаться к вопросу, то, на мой взгляд, точнее назвать целевое соединение просто ТАГом, т.е. типа TG (С2:0/С18:0/С18:0), т.к. название ацетил-ДАГ (или ацетил-ТАГ) больше указывает на то, что ацетил висит где-то на хвостах жирных кислот (имеющих гидроксильные группы). Лично у меня, это первое, что приходит в голову от таких названий

  Ответов в этой теме: 16
  Страница: 1 2
  «« назад || далее »»

Ответ на тему



ПОСЛЕДНИЕ НОВОСТИ ANCHEM.RU:      [ Все новости ]

ЖУРНАЛ ЛАБОРАТОРИИ ЛИТЕРАТУРА ОБОРУДОВАНИЕ РАБОТА КАЛЕНДАРЬ ФОРУМ

Copyright © 2002-2009
«Аналитика-Мир профессионалов»

Размещение рекламы / Контакты