Российский химико-аналитический портал  химический анализ и аналитическая химия в фокусе внимания ::: портал химиков-аналитиков ::: выбор профессионалов  
карта портала ::: расширенный поиск              
 


ANCHEM.RU » Форумы » 1. Аналитический форум ...
  1. Аналитический форум | Список форумов | Войти в систему | Регистрация | Помощь | Последние темы | Поиск

Форум химиков-аналитиков, аналитическая химия и химический анализ.

Программы для просмотра масс-спектров в формате RAW? >>>

  Ответов в этой теме: 16
  Страница: 1 2
  «« назад || далее »»

[ Ответ на тему ]


Автор Тема: Программы для просмотра масс-спектров в формате RAW?
vik15
Пользователь
Ранг: 58

30.01.2008 // 9:46:33     
Уважаемые коллеги, подскажите пожалуйста. Возникла такая ситуация, нам наснимали масс-спектров на приборе Thermo, оператор спектры копировал в Word и в таком виде сохранял, еще нам дали raw файлы. Возможно ли на стороннем компьютере где нет Xcalibur их просмотреть и с помощью каких программ. Нашли несколько конвертеров типа ReAdW в формат mzXML и просмотрщики для этого формата, но они работают только если есть установленный Xcalibur. Спектров много, оператор занят и не может их расписывать под наши нужды, есть ли выход?
ANCHEM.RU
Администрация
Ранг: 246
Lgosn
Пользователь
Ранг: 93


30.01.2008 // 10:09:26     
С этим Xcalibur, вообще шило, у меня тоже было несколько спектров в этом формате, да еще и эта програмулина в придачу, но так и не смог с ней разобраться. Если в остальных программах по просмотру и анализу спектров все относительно просто и доступно. То там что-то накручено, эти спектры так и лежат без дела.
lostbyte
Пользователь
Ранг: 166


30.01.2008 // 11:57:04     
Редактировано 1 раз(а)

В Xcalibur встроен штатный конвертер, который может выдавать, например, ANDI (*.cdf) файлики, читаемые много чем (например AMDISом, который идет с базой NIST). Отконвертировать-дело одной минуты. Lgosn, может быть вы не очень разобрались в программе, но Xcalibur мне показался удобнее многих других. Особенно версия 1.4, в которой убрали несколько сильно раздражающих ошибок.
vik15
Пользователь
Ранг: 58


30.01.2008 // 17:49:57     

lostbyte пишет:
В Xcalibur встроен штатный конвертер, который может выдавать, например, ANDI (*.cdf) файлики, читаемые много чем (например AMDISом, который идет с базой NIST). Отконвертировать-дело одной минуты. Lgosn, может быть вы не очень разобрались в программе, но Xcalibur мне показался удобнее многих других. Особенно версия 1.4, в которой убрали несколько сильно раздражающих ошибок.

Уважаемый Lostbyte, а не подскажете где и как в Xcalibur пользоваться штатным конвертером. Оператор говорит, что не знает про конвертер, молодой человек, опыта еще мало, наверно ему не требовалось в другие форматы записывать раньше.
lostbyte
Пользователь
Ранг: 166


30.01.2008 // 18:22:53     
Roadmap View (открывается при запуске Xcaliburа)->Tools->File Converter. Выставить Source data type *.raw, Destination data type *.cdf, указать путь к файлам, выбрать нужные, Add Job(s), Convert.
Vladimir_U
Пользователь
Ранг: 111


31.01.2008 // 9:12:26     
Редактировано 1 раз(а)


lostbyte пишет:
В Xcalibur встроен штатный конвертер, который может выдавать, например, ANDI (*.cdf) файлики, читаемые много чем (например AMDISом, который идет с базой NIST)....
AMDIS и сам может прекрасно читать и обрабатывать *.raw файлы, а также искать в библиотеке NIST. Мы планируем на своем сайте разместить статью с условным названием "КАК РАБОТАТЬ В AMDIS". Основа статьи в принципе готова, но надо кое-что подправить.
Каталог ANCHEM.RU
Администрация
Ранг: 246
Аквадистиллятор из нержавеющей стали UD-1100 Аквадистиллятор из нержавеющей стали UD-1100
Предназначены для производства дистиллированной воды, отвечающей требованиям государственной фармакопеи. Применяются в медицинских учреждениях, аптеках, лабораториях и для технических нужд. Производительность - не менее 10 л/ч. Мощность: 7,5 КВт.
[ Информация из каталога оборудования ANCHEM.RU ]
lostbyte
Пользователь
Ранг: 166


31.01.2008 // 10:41:01     
Редактировано 1 раз(а)

Статья по использованию AMDIS будет напечатана в ближайших номерах "Масс-спектрометрии" (я так понимаю, что она как раз из вашей организации пришла). Со своей стороны хочу сказать, что AMDISом мы пользуемся постоянно для расчета RI, и у нас были проблемы с чтением файлов Xcaliburа, поэтому пользуемся конвертером.
Lgosn
Пользователь
Ранг: 93


01.02.2008 // 11:04:48     

lostbyte пишет:
В Xcalibur встроен штатный конвертер, который может выдавать, например, ANDI (*.cdf) файлики, читаемые много чем (например AMDISом, который идет с базой NIST). Отконвертировать-дело одной минуты. Lgosn, может быть вы не очень разобрались в программе, но Xcalibur мне показался удобнее многих других. Особенно версия 1.4, в которой убрали несколько сильно раздражающих ошибок.

Да я не спорю, может быть действительно удобная програма, только с ходу разобраться в ней сложно.
Lgosn
Пользователь
Ранг: 93


01.02.2008 // 11:06:05     
Я так и не смог как можно сделать выборку по одному иону или нескольким ионам. Может вы посоветуте в двух словах.
lostbyte
Пользователь
Ранг: 166


01.02.2008 // 11:16:31     
Редактировано 1 раз(а)

Qual Browser (ну это вообщем понятно )
1. Если нужен TIC, то по активной (кнопочка на зеленом фоне) хроматограмме правой кнопкой, в выпавшем меню Ranges..., ставите еще одну галку и указываете диапазон масс.
2. Если TIC не нужен, то при активной хроматограмме просто щелкаете мышкой по пику или выделяете диапазон на спектре.
А вообще там в хелпе есть раздел How do I...? И он весьма полезен.
Lgosn
Пользователь
Ранг: 93


02.02.2008 // 9:24:45     
Бошьшое спасибо, дело сдвинулось с мертвой точки, осталось только найти как площадь пиков посчитать.

  Ответов в этой теме: 16
  Страница: 1 2
  «« назад || далее »»

Ответ на тему


ААС, ИСП-АЭС, ИСП-МС - прямые поставки в 2022 году

ПОСЛЕДНИЕ НОВОСТИ ANCHEM.RU:      [ Все новости ]


ЖУРНАЛ ЛАБОРАТОРИИ ЛИТЕРАТУРА ОБОРУДОВАНИЕ РАБОТА КАЛЕНДАРЬ ФОРУМ

Copyright © 2002-2022
«Аналитика-Мир профессионалов»

Размещение рекламы / Контакты