Форумы ANCHEM.RU: Он-лайн базы масс-спектров

Российский химико-аналитический портал

химический анализ и аналитическая химия в фокусе внимания ::: портал химиков-аналитиков ::: выбор профессионалов

карта портала ::: расширенный поиск

ANCHEM.RU » Форумы » 1. Аналитический форум ...

Форум химиков-аналитиков, аналитическая химия и химический анализ.

Он-лайн базы масс-спектров >>>

  Ответов в этой теме: 28
  Страница: 1 2 3
  «« назад || далее »»

[ Ответ на тему ]

lostbyte
Пользователь
Ранг: 166

13.11.2010 // 10:14:13

Редактировано 2 раз(а)

igor339 пишет:
Я не совсем понял куда мне войти, в амдис или вариан. Если вариан, то у меня его нет. И следовательно я должен входить в солушен и отключать эту функцию в нем? Т.к. солушен создает фаилы данных просто в формате вариан. А амдис думает, что он открывает фаилы вариана.

Дело в том, что компания Microsoft ввела в операционную систему Windows XP возможность одновременного использования нескольких пользовательских сеансов, которая называется Fast User Switching. В некоторых версиях XP (особенно пиратских сборках) эта опция включена по умолчанию. AMDIS не корректно работает на операционных системах с включенной опцией Fast User Switching, в частности может не открывать файлы. Поэтому ее нужно отключить. Последовательность, приведенная в моем посте, относится к действиям выполняемым в операционной системе и ведет к отключению этой опции в системе. С большой вероятностью это приведет к восстановлению работоспособности AMDIS.

ANCHEM.RU
Администрация
Ранг: 246

virtu
VIP Member
Ранг: 2133

13.11.2010 // 18:29:21

Дмитрий (anchem.ru) пишет:

2Virtu, в амдис надо для обработки и создания собственных баз пользователя - все же выше по теме есть.

Пользуясь случаем не подскажите можно ли в массбанке искать соединение по своему спектру...

Хотя диск с амдисом, MS Search и др. был в комплекте к прибору.

Вам проще ее сделать в NIST MSSearch.

igor339
Пользователь
Ранг: 15

13.11.2010 // 22:43:58

virtu пишет:

Дмитрий (anchem.ru) пишет:

2Virtu, в амдис надо для обработки и создания собственных баз пользователя - все же выше по теме есть.
Пользуясь случаем не подскажите можно ли в массбанке искать соединение по своему спектру...

Хотя диск с амдисом, MS Search и др. был в комплекте к прибору.

Вам проще ее сделать в NIST MSSearch.

Я думаю, что можно с этой целью я и хочу открыть свои фаилы в амдис. А затем в MS Search сохранить спектр неизвестного соединения.
В массбанке есть вкладка Spectrum Search и в ней есть кнопка "Обзор" нажав на которую вы выбираете фаилы на своем компьютере. Я думаю это для того, чтобы загрузить свой спектр на сайт, правда не знаю в каком формате нужен спектр.

igor339
Пользователь
Ранг: 15

13.11.2010 // 22:49:56

Спасибо всем большое!

Разобрался с Fast User Switching. Наконец то мои фаилы открылись в амдис. Сначала не заметил ссылку на страницу майкрософт, а когда прочитал проблема решилась за минуту.

Дмитрий (anchem.ru)
Администратор
Модератор форума
Ранг: 4443

14.11.2010 // 3:44:18

Кстати, интересно про масс-банк.
Про спектры высокого, МС-МС и других способов ионизации все понятно... А вот коллекция спектров EI низкого разрешения там... Есть-ли там что-нибудь чего нет в NIST08?

P.S. Мне вообще очень понравилась сама идея как этот проект сделан. Нравится привязка к приборам, на которых получен спектр. Вот бы такое у нас замутить... ГХ/МС то в РФ все больше и больше...

Каталог ANCHEM.RU
Администрация
Ранг: 246

Анализатор влажности «Элвиз-2 (2С)»
Термогравиметрический влагомер «ЭЛВИЗ-2 (2С)» предназначен для точного и быстрого измерения влажности монолитных, сыпучих, пастообразных материалов, а также сухого остатка в жидких образцах.

[ Информация из каталога оборудования ANCHEM.RU ]

Дмитрий (anchem.ru)
Администратор
Модератор форума
Ранг: 4443

14.11.2010 // 4:54:15

Создание файлов для поиска в масс-банке:
1. сохраняете в AMDIS файл спектра (extracted) в *.msp
2. утилитой LIB2NIST (можно скачать по chemdata.nist.gov/mass-spc/ms-search/Library_conversion_tool.html ) конвертируете в *.sdf
3. Открываете это файл в блокноте, копируете только две колонки (масса-интенсивность, после сточки MASS SPECTRAL PEAKS, до строчки $$$$ ), вставляете в пустой текстовый файл, сохраняете его (обязательно с английским именем) и подсовываете масс-банку...

Инструкция по масс-банку:
www.massbank.jp/manuals/UserManual_en.pdf

virtu
VIP Member
Ранг: 2133

15.11.2010 // 1:07:53

Редактировано 1 раз(а)

Дмитрий (anchem.ru) пишет:
А вот коллекция спектров EI низкого разрешения там... Есть-ли там что-нибудь чего нет в NIST08?

Не сталкивался. Может быть и есть. Обычно как, если ОЧЕНЬ надо, начинаешь "копать" все и вся.

P.S. Мне вообще очень понравилась сама идея как этот проект сделан. Нравится привязка к приборам, на которых получен спектр. Вот бы такое у нас замутить... ГХ/МС то в РФ все больше и больше...

Не покатит данная идея у нас, если Вы о EI, а для всего остального еще рано. Причин достаточно много, от банальной лени до конфиденциальности и недостатка нужной инфы/навыков.
ИМХО Лучше бы покатила ситуация, если помимо инфы "стандартов" люди бы выкладывали "спектры", ИУ и т.д. unknown compounds, ессно с доп. инфой (объекты, условия, контактная инфа и т.д.) - таких "вещей" я вообще нигде не видел. Понятно, что это намного быстрее, чем "общаться" через публикации и т.д.

ex-KNIISE
Пользователь
Ранг: 438

19.11.2010 // 13:09:04

lostbyte - большое спасибо за интересную инфу!
А может еще есть какие подводные камни у АМДИСа?
Что то типа FAQ?


Ответов в этой теме: 28 Страница: 1 2 3 «« назад \|\| далее »»	Ответ на тему

ПОСЛЕДНИЕ НОВОСТИ ANCHEM.RU: [ Все новости ]

Размещение рекламы / Контакты