Российский химико-аналитический
портал |
химический анализ и аналитическая химия в фокусе внимания ::: портал химиков-аналитиков ::: выбор профессионалов |
![]() |
|
ANCHEM.RU » Форумы » 1. Аналитический форум ... |
![]() |
масс-спектры >>>
|
![]() |
Олег Пользователь Ранг: 531 |
![]() Редактировано 2 раз(а) ... Цифры масс точно не совпадают, но порядок похож с данными мс-мс 500-700 Не понял. Совпадение масс должно быть точным, на то это и масс спек. Что такое 500-700 - это интактная масса? - Да, интактная масса, но это пределы значений масс на МАЛДИ. Их много и все не указываю. Вы видите точно эту массу как 1+ / 2+ в LC/MS (сделайте ТIX). Эту массу фрагментировали? Если нет, поставьте массу одно и дву- зарядника в inclusion list, так чтобы не потерять. Не знаю. Хочу спросить у тех кто делал. "Долбить" по массе: вы можете вводить в масс-спектрометр вашу смесь напрямую, без LC например чере nanospray source. Тогда (поскольку вам не надо гонятся за всеми пиками) вы можете снимать МС/МС с вашей массы пока проба не кончится и, меняя colliion energy, добится качественного спектра - те кто делал вряд ли согласятся "долбить" - они один раз сняли и - будь свободен... У них своих дел много. Вы также можете этерифицировать часть пробы и пальнуть по пику полнстью этерифицированного пептида. Сопоставляя спектры, можно надежнее читать сиквенс (для триптических пептидов это вообще классно работает). Да, конечно попробую. Уже делал, но не смог снять мс-спектр. На МАЛДИ что-то не получилось. Делали бесплатно, может не захотели возиться... Спасибо за советы. Есть над чем поработать. Только вот прибора нет ![]() Вы так много тратили время на меня, может быть Вы бы дали мне свои координаты и с меньшей затратой времени и большей эффективностью для меня мы смогли бы побеседовать? Еще раз спасибо. |
ANCHEM.RU Администрация Ранг: 246 |
|
Олег Пользователь Ранг: 531 |
![]()
|
Spectrometrist Пользователь Ранг: 777 |
![]() Редактировано 1 раз(а) Олег, еше раз: елси вы сами не масс-спек / протеомный специалист, интерепретация raw data и стратегия анализа не ваша работа. Если вы биохимик, то ваша работа хорошо делать биохимию и выдать интересный, хорошо публикуемый результат (если вы в академии), цели в компании разнятся так что выберете сами. Для этого вы должны работать в хорошем контакте протеомными специалистами и найти таких которые грамотно интерепретируют (!) результаты, а не просто скинут вам спектры на руки. Заочные консультации тут не помогут, нужно вместе анализировать данные по мере их поступления и решать что делать дальше. Я должен извинится, но, по многим причинам, я не могу заниматься вашей проблемой экспериментально. Я подробно обсуждал вашу проблему здесь на форуме с образовательной целью, так как ваша проблема достаточно общая, так что теперь достаточно указать на ветку форума как зайдет (не обязательно на этом форуме) разговор о планировании протеомного эксперимента. И, еще один совет: если вы не удовлетворены сотрудничеством с этой лабораторией, ищите другую: как вариант, запостите краткое описание проекта на molbiol.ru, vmso.ru или (но тут вы должны написать интересное письмо!) на abrf.org , это сайт core facility people, очень профессиональный. Но я бы начал с Российских лабораторий т.к. вам нужен прямой, непосредственный контакт. Удачи и спрашивайте, если что. |
ayuna Пользователь Ранг: 6 |
![]() Редактировано 1 раз(а) Пользователь удалил свое сообщение |
|
||
Ответов в этой теме: 34
|
|
ЖУРНАЛ | ЛАБОРАТОРИИ | ЛИТЕРАТУРА | ОБОРУДОВАНИЕ | РАБОТА | КАЛЕНДАРЬ | ФОРУМ |
Copyright © 2002-2022 «Аналитика-Мир профессионалов» |
Размещение рекламы / Контакты |